matio 1.5.28 に問題が発見されました。Mat_VarCreateStruct() において、nfields の値が fields 配列内の実際の文字列数と一致しない場合、ヒープベースのメモリ破損が発生する可能性があります。この問題が原因で、クリーンアップ中に範囲外読み取りや無効なメモリ解放が行われ、結果としてセグメンテーションフォルトやヒープ破損が発生します。

正式な対策が公開されています。ベンダ情報を参照して適切な対策を実施してください。